堆肥检测——复达客户检测案例
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417 2021年6月28日，客服中心反馈国内某环境研究院有堆肥样品检测的需求，接到反馈后，材料检测实验室工程师第一时间与客户进行详细沟通，情况如下：
客户背景
客户是国内某环境研究院的学生，做了一个关于堆肥样品的研究课题，需要检测堆肥样品的一些元素，便于课题开展。
样品名称
堆肥样品
测试项目
氮、磷、钾、总碳、腐殖酸。
客户需求
需要检测土壤里面氮、磷、钾、总碳、腐殖酸，得出数据用于课题研究。
解决方案
分析流程：
首先对高通量测序下机的双端序列原始数据进行质量筛查，获取可用于下游宏基因组学分析的高质量数据集（Clean data） 。 随后对每个样本的高质量序列分别进行宏基因组序列拼接组装，构建宏基因组 Contigs 和 Scaffolds 序列集，并进行基因预测，获得非冗余蛋白序列集。随后，对蛋白序列用多种常用数据库进行功能注释，获得各等级的功能类群丰度谱，并进行差异比较分析、代谢通路富集分析、聚类分析等。同时，我们也对基因序列进行物种注释，获得种以及种以下精细水平的物种组成谱，并进行差异比较分析、聚类分析、物种组成丰富度和均匀度分析和关联网络分析等。基于上述获得的功能丰度谱和物种组成谱，可以进一步对宏基因组样本进行 Alpha 和Beta 多样性分析，进而依靠多种多变量统计学方法筛选得到宏基因组中的关键生物标记物（如关键功能/物种类群） 。 同时，通过多种多种数据可视化和交互式工具，绘制具备论文发表水准的二维/三维图表，全方位、客观地呈现以上分析结果。此外，我们还将根据样本来源，选择特定的功能数据库进行注释分析。
检测结果：
客户反馈
通过我们的检测，客户的课题研究有了原始数据的支撑，并且对我们的数据非常满意，后面又陆续送了几十批样品。
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