蛋白全序列分析——复达客户检测案例
2021年10月15日,客服中心反馈上海某法院有一则知识产权纠纷案件,涉及到蛋白质的专利序列,需要进行蛋白质一级结构鉴定。蛋白质实验室工程师第一时间与客户进行详细沟通,情况如下:
上海某法院承担了改革先行先试的任务,按照知识产权专业化审判的规律,积极探索和推进改革,设立专业化审判组织、建立多元化技术事实查明制度体系、建立技术调查官制度、建立专业智库、开展专业化司法公信力评估,以信息化促进改革、提供便民诉讼服务,取得了阶段性成效。在服务创新驱动发展战略、服务自贸区建设、服务上海建设具有全球影响力的科技创新中心大局中,充分发挥知识产权司法保护主导作用,得到了人大代表、政协委员和国际同行的普遍赞誉和充分肯定。
ICA固定化头孢菌素C酰化酶
客户是上海某法院,帮助当事人双方寻求机构进行蛋白质一级结构检测。客户之前做过很多次测试,但是数据结果都不理想。序列覆盖率都不能达到100%,无法判断样品的实际一级序列。客户找到我们,希望出完整的方案,并进行测试。
签订合同后,蛋白质实验室工程师第一时间对理论序列进行分析,确定了3种针对理论序列的特殊蛋白酶。基于LCMS/MS平台分析ICA固定化头孢菌素C酰化酶全序列。针对样品理论序列,设计适用的多种蛋白酶,蛋白质通过多种酶切后,裂解成多种小分子多肽片段。本项目使用NanoLC-Obitrap 质谱仪对多肽片段进行解析,样品被离子化后进入质谱仪,得到一级质谱图后,筛选母离子进行二级质谱图解析肽段序列。最后根据理论序列综合分析比对得出蛋白质的一级氨基酸序列。
客户对数据非常认可,序列覆盖率达到100%。